Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdlim7Q3TJD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdlim7Q3TJD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms