Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VrtnQ3SYK4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VrtnQ3SYK4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.2 ms