Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmklr1P97468 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmklr1P97468 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmklr1P97468 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms