Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psme1P97371 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Psme1P97371 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psme1P97371 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psme1P97371 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Psme1P97371 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psme1P97371 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Psme1P97371 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms