Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd13P70217 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd13P70217 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd13P70217 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms