Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcmtd1P59913 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcmtd1P59913 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms