Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Samsn1P57725 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samsn1P57725 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samsn1P57725 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms