Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atoh1P48985 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh1P48985 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh1P48985 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms