Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdkn1bP46414 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms