Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hmx3P42581 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx3P42581 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms