Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5cP41230 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5cP41230 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5cP41230 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5cP41230 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms