Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TfamP40630 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TfamP40630 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TfamP40630 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TfamP40630 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TfamP40630 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TfamP40630 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TfamP40630 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TfamP40630 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TfamP40630 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TfamP40630 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TfamP40630 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TfamP40630 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TfamP40630 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms