Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpardP35396 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpardP35396 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpardP35396 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PpardP35396 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PpardP35396 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PpardP35396 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpardP35396 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpardP35396 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpardP35396 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpardP35396 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpardP35396 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpardP35396 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpardP35396 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpardP35396 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpardP35396 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpardP35396 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpardP35396 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpardP35396 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpardP35396 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpardP35396 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms