Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptpn11P35235 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn11P35235 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn11P35235 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms