Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc6a9P28571 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc6a9P28571 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms