Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bmi1P25916 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bmi1P25916 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmi1P25916 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.8 ms