Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18525 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18525 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P18525 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P18525 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P18525 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P18525 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P18525 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18525 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18525 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P18525 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P18525 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18525 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18525 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18525 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms