Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Msh3P13705 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh3P13705 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh3P13705 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msh3P13705 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Msh3P13705 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh3P13705 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msh3P13705 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msh3P13705 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms