Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd5P13379 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd5P13379 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms