Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FlgP11088 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FlgP11088 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FlgP11088 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FlgP11088 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FlgP11088 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FlgP11088 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FlgP11088 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FlgP11088 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FlgP11088 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FlgP11088 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FlgP11088 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FlgP11088 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FlgP11088 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FlgP11088 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FlgP11088 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FlgP11088 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FlgP11088 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FlgP11088 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FlgP11088 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FlgP11088 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FlgP11088 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FlgP11088 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FlgP11088 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FlgP11088 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FlgP11088 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FlgP11088 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FlgP11088 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FlgP11088 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FlgP11088 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FlgP11088 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FlgP11088 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FlgP11088 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FlgP11088 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FlgP11088 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FlgP11088 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms