Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04944 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04944 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04944 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04944 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04944 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04944 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04944 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04944 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04944 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04944 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P04944 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04944 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04944 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04944 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P04944 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04944 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04944 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P04944 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P04944 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms