Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01725 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01725 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01725 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01725 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01725 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01725 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01725 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01725 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01725 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01725 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01725 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01725 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01725 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms