Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01655 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01655 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01655 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01655 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01655 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01655 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01655 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01655 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01655 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01655 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01655 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01655 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01655 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01655 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms