Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sypl2O89104 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sypl2O89104 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sypl2O89104 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sypl2O89104 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sypl2O89104 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sypl2O89104 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms