Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsnO88737 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsnO88737 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsnO88737 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsnO88737 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsnO88737 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BsnO88737 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BsnO88737 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BsnO88737 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BsnO88737 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BsnO88737 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
BsnO88737 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BsnO88737 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BsnO88737 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms