Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CaskO70589 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CaskO70589 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CaskO70589 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CaskO70589 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CaskO70589 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CaskO70589 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CaskO70589 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CaskO70589 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CaskO70589 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CaskO70589 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CaskO70589 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CaskO70589 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CaskO70589 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms