Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BckdkO55028 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BckdkO55028 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BckdkO55028 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms