Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpd52l1O54818 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpd52l1O54818 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms