Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1baO35930 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Gp1baO35930 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Gp1baO35930 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Gp1baO35930 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Gp1baO35930 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1baO35930 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1baO35930 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms