Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms