Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IfnabL7MTU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IfnabL7MTU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IfnabL7MTU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms