Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930544D05RikJ3QK56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms