Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms