Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8247F6VRJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8247F6VRJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms