Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms