Protein–RNA interactions for Protein: E9Q346

Vmn1r160, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r160E9Q346 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r160E9Q346 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r160E9Q346 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms