Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gimd1E9PW74 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gimd1E9PW74 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms