Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AU019823E9PUQ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AU019823E9PUQ3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AU019823E9PUQ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms