Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc78D3Z5T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc78D3Z5T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc78D3Z5T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms