Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scn7aB1AYL1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scn7aB1AYL1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn7aB1AYL1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scn7aB1AYL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms