Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm436B1AVU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm436B1AVU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm436B1AVU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm436B1AVU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm436B1AVU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm436B1AVU6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm436B1AVU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.2 ms