Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trabd2bB1ATG9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trabd2bB1ATG9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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