Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Herc3A6H6S0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Herc3A6H6S0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc3A6H6S0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms