Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam209A2APA5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam209A2APA5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam209A2APA5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms