Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd4A2AKM2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hacd4A2AKM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hacd4A2AKM2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms