Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Setbp1Q9Z180 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Setbp1Q9Z180 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Setbp1Q9Z180 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Setbp1Q9Z180 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Setbp1Q9Z180 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Setbp1Q9Z180 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Setbp1Q9Z180 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
Setbp1Q9Z180 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Setbp1Q9Z180 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Setbp1Q9Z180 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Setbp1Q9Z180 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Setbp1Q9Z180 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Setbp1Q9Z180 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Setbp1Q9Z180 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Setbp1Q9Z180 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Setbp1Q9Z180 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Setbp1Q9Z180 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Setbp1Q9Z180 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Setbp1Q9Z180 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Setbp1Q9Z180 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Setbp1Q9Z180 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Setbp1Q9Z180 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
Setbp1Q9Z180 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Setbp1Q9Z180 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Setbp1Q9Z180 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Setbp1Q9Z180 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Setbp1Q9Z180 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Setbp1Q9Z180 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Setbp1Q9Z180 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Setbp1Q9Z180 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Setbp1Q9Z180 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Setbp1Q9Z180 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Setbp1Q9Z180 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Setbp1Q9Z180 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Setbp1Q9Z180 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Setbp1Q9Z180 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Setbp1Q9Z180 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Setbp1Q9Z180 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Setbp1Q9Z180 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Setbp1Q9Z180 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Setbp1Q9Z180 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Setbp1Q9Z180 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Setbp1Q9Z180 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Setbp1Q9Z180 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Setbp1Q9Z180 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Setbp1Q9Z180 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Setbp1Q9Z180 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Setbp1Q9Z180 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Setbp1Q9Z180 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Setbp1Q9Z180 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Setbp1Q9Z180 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Setbp1Q9Z180 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Setbp1Q9Z180 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Setbp1Q9Z180 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Setbp1Q9Z180 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Setbp1Q9Z180 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Setbp1Q9Z180 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Setbp1Q9Z180 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Setbp1Q9Z180 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Setbp1Q9Z180 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Setbp1Q9Z180 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Setbp1Q9Z180 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Setbp1Q9Z180 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Setbp1Q9Z180 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Setbp1Q9Z180 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Setbp1Q9Z180 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Setbp1Q9Z180 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Setbp1Q9Z180 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Setbp1Q9Z180 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Setbp1Q9Z180 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Setbp1Q9Z180 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Setbp1Q9Z180 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms