Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vsig2Q9Z109 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vsig2Q9Z109 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vsig2Q9Z109 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vsig2Q9Z109 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig2Q9Z109 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig2Q9Z109 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vsig2Q9Z109 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vsig2Q9Z109 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vsig2Q9Z109 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vsig2Q9Z109 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vsig2Q9Z109 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vsig2Q9Z109 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vsig2Q9Z109 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsig2Q9Z109 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms