Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L0

Tpbg, Trophoblast glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbgQ9Z0L0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TpbgQ9Z0L0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TpbgQ9Z0L0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TpbgQ9Z0L0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TpbgQ9Z0L0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TpbgQ9Z0L0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TpbgQ9Z0L0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TpbgQ9Z0L0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TpbgQ9Z0L0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TpbgQ9Z0L0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TpbgQ9Z0L0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TpbgQ9Z0L0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TpbgQ9Z0L0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TpbgQ9Z0L0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TpbgQ9Z0L0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TpbgQ9Z0L0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TpbgQ9Z0L0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TpbgQ9Z0L0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TpbgQ9Z0L0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TpbgQ9Z0L0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TpbgQ9Z0L0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TpbgQ9Z0L0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms