Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gdf15Q9Z0J7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdf15Q9Z0J7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf15Q9Z0J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf15Q9Z0J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf15Q9Z0J7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf15Q9Z0J7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf15Q9Z0J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf15Q9Z0J7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gdf15Q9Z0J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf15Q9Z0J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf15Q9Z0J7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf15Q9Z0J7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdf15Q9Z0J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf15Q9Z0J7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdf15Q9Z0J7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdf15Q9Z0J7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdf15Q9Z0J7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdf15Q9Z0J7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdf15Q9Z0J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdf15Q9Z0J7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms