Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ap4s1Q9WVL1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ap4s1Q9WVL1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ap4s1Q9WVL1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ap4s1Q9WVL1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap4s1Q9WVL1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap4s1Q9WVL1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap4s1Q9WVL1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap4s1Q9WVL1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap4s1Q9WVL1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap4s1Q9WVL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ap4s1Q9WVL1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap4s1Q9WVL1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ap4s1Q9WVL1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ap4s1Q9WVL1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms